Bienvenidos a la Facultad de Medicina de la UNI,  novel institución de formación de Profesionales Médicos, creada por ley Nº 1009/96 Dentro del marco de un Convenio de Cooperación Técnico- Científico con el Ministerio de Salud Pública  y  Bienestar Social. Este convenio ha permitido estructurar la Facultad,  ediliciamente  en el predio del Hospital Regional de Encarnación. Al poco tiempo, ampliación de convenio mediante se ha dado la articulación Docente – Asistencial, de tal modo que el Hospital Regional  toma un rumbo diferente, pasando a constituirse en Hospital – Escuela, ya que los Programas Académicos de la Carrera contemplan Practicas Tutoriales, Pasantías  y Servicios Asistenciales.

De esta manera y con la ejecución de Pasantías en Zonas Rurales de la Región y del País, así como rotaciones por servicios de Complejidad de la Capital, los Primeros Egresados de la Facultad (21 Médicos Cirujanos) en el año 2002, reciben sus diplomas Académicos de Médicos – Cirujanos, marcando un Hito Histórico  en el escenario Regional y Nacional, ya que esta es la Primera Facultad de Medicina de una Universidad Pública , creada después de la Facultad De Ciencias Medicas de la Universidad Nacional de Asunción.

Desde entonces y hasta la actualidad, gracias a la aplicación de estrategias académicas de rigor y calidad, tanto para el acceso a la carrera, como  durante el proceso de formación Profesional, la Facultad ha dado resultados  sumamente satisfactorios (257 Médicos- Cirujanos) para la Región, el País y el Mundo. Así, la institución se perfila como  una Facultad de Medicina  cuya calidad se halla un sitial  y un prestigio privilegiado en el escenario Nacional.